Les ordres militaires et hospitaliers (ordre de Saint-Jean de Jérusalem, de Rhodes et de Malte ; ordre de Saint-Antoine de Viennois ; ordre de Saint-Lazare et du Mont-Carmel) n'ont laissé que peu d'archives dans le Cantal.
C'est que le principal d'entre eux, l'ordre de Malte, avait au XVIIIe siècle son chef-lieu prioral, celui de la langue d'Auvergne, à Lyon, où ses archives sont toujours conservées. Les établissements hospitaliers de Haute-Auvergne, chefs-lieux d'exploitation, n'ont laissé que des épaves de ce qui pouvait servir à la gestion domaniale des commanderies ou préceptories.
Outre les archives pontificales et maltaises elles-mêmes et les fonds des archives départementales du Rhône et du Puy-de-Dôme (dans une moindre mesure), on peut citer aux archives du Cantal :
- les fonds judiciaires seigneuriaux : 16 B 305-306 pour Carlat, 16 B 321-329 et 1212 pour Celles, 16 B 680-681 pour Loubizargues, 16 B 799-802 pour Montchamp, 16 B 1208-1209 pour Ydes, 103 F 8 pour Saint-Jean-de-Dône et Ourzeaux ;
- les terriers conservés dans les archives communales déposées : 5 E 200-206 pour Celles ;
- les dossiers de gestion domaniale d'origine privée : 1 E 322 pour Saint-Antoine près Marcolès (1770-1788) ; 113 F 8 pour la commanderie de Rosson à Saint-Christophe (1282-1787) ; 380 F 1 à 6 pour la commanderie de Carlat, dans les papiers des Sadourny, qui en furent fermiers (XVIe-XVIIIe siècle).
- les terriers, fragments de terriers et reconnaissances isolées en originaux ou copies pour Saint-Jean-de-Dône (103 F 74, 286 F 3 et 318 F 1), Celles (153 F 3 et 420 F 1), Carlat (333 F 2 et 373 F 4), ainsi que des pièces isolées concernant le patrimoine de la commanderie de Carlat (102 F 149, 103 F 58, 219 F 1, 1 J 116/1) ;
- un terrier (1509) et une liève (s.d. [XVIe siècle]) de cens et rentes dus à la commanderie de la Bessière (Saint-Julien-de-Piganiol, Aveyron) tant en Rouergue qu'en Auvergne : 1 J 116/1 ;
- les dossiers de biens nationaux : sous-série 1 Q, passim, et 339 F ;
- une liève et un terrier pour Montchamp (1662-1667 et 1762-1768) conservés dans une collection privée mais microfilmés : 1 MI 56-57.
Aux archives départementales du Rhône, Inventaire analytique de la sous-série 48 H (ordre de Malte, langue d'Auvergne), 4 volumes, 1895-1978. La langue d'Auvergne fut dirigée depuis Bourganeuf puis Montferrand avant l'installation à Lyon.
Hippolyte Bouffet, Les templiers et les hospitaliers de Saint-Jean en Haute-Auvergne, Marseille, Laffite reprints, 1976 : paru pour la première fois dans la Revue de la Haute-Auvergne, 1914-1916 ;
Lucien Gerbeau et Jean-Eric Iung, "La commanderie de Celles en 1373 : l'enquête pontificale sur l'ordre de Saint-Jean de Jérusalem dans le diocèse de Saint-Flour", dans Revue de la Haute-Auvergne, tome 59, 1997, pages 241-260 ;
Félix Jalenques, "Les religieux hospitaliers et les prieurs qui leur ont succédé à Saint-Antoine", dans Revue de la Haute-Auvergne, tome 29, 1935, pages 121-136 [travail inégal sujet à révision] ;
Louis de Ribier, Les chevaliers de Saint-Lazare de Jérusalem (...) en Haute-Auvergne : commanderie de Rosson, Aurillac, 1901.